Elle est née le 19 septembre 1979 dans la ville de Buzuluk, région d'Orenbourg.
En 2001, elle est diplômée de l'Université d'État d'Irkoutsk avec un diplôme en journalisme. Elle a travaillé comme présentatrice de nouvelles et rédactrice sur Channel 21 à Irkoutsk. Après avoir quitté la télévision, elle a travaillé comme journaliste indépendante. Elle a travaillé à Irkoutsk en tant que rédactrice en chef de la chaîne NTS, animatrice de l'émission Special Opinion.
En 2010, elle est diplômée des cours supérieurs pour scénaristes et réalisateurs à Moscou (atelier d'Andrey Gerasimov et Andrey Dobrovolsky).
En 2022, Natalia Merkoulova et Alekseï Tchoupov ont quitté la Russie et sont partis à Bakou (Azerbaïdjan) où ils projettent de créer une école de cinéma.