Alena Babenko est née le 31 mars 1972 à Kemerovo. Elle a fait ses études à la faculté de mathématiques de l'Université de Tomsk. Elle a travaillé au théâtre d'étudiants Estus (Эстус). Puis elle a fait des études au VGIK (Institut national du cinéma) jusqu'en 2000 (classe de A. Romachine).